诸葛亮作为顶级智力武将，虽然拥有极高的战略价值，但仍存在一些明显的战术弱点需要玩家注意。其自带战法神机妙算虽能克制主动战法，但面对指挥、被动类战法时效果有限，尤其在后期赛季主流阵容中，当对手采用贾诩、司马懿等依赖被动输出的武将时，诸葛亮的控制能力会大幅下降。其战法触发依赖敌方行动，若遭遇低速队伍或普攻型阵容，容易陷入被动局面。
诸葛亮的兵种适应性虽涵盖弓、枪、器械三种S级，但缺乏骑兵适性导致机动性不足。在对抗藤甲兵或陷阵营等高防御兵种时，其谋略输出可能因兵种克制而难以突破，特别是面对带有火炽原燎等灼烧战法的队伍时，藤甲兵的反伤机制会进一步削弱诸葛亮的生存能力。其统率成长虽优于多数谋士，但相比专业防御型武将仍显不足，在遭遇爆头骑或三势吕等高爆发队伍时可能快速溃败。
作为高统御值武将（7统御），诸葛亮在开荒期和前期资源紧张阶段难以快速成型，需要玩家优先升级君王殿才能启用。其核心战法如夺魂挟魄、杯蛇鬼车均为稀有战法，平民玩家获取难度较大。而在后期赛季中，随着SP诸葛亮等新武将的出现，普通诸葛亮在属性与功能性上会逐渐被替代，部分玩家甚至将其转为器械队长使用，这种定位变化反映了其在版本迭代中的局限性。
队伍搭配方面，诸葛亮极度依赖特定武将形成体系。传统的蜀智阵容（诸葛亮+庞统+法正）需要三个高统御武将支撑，而西蜀之智的缘分加成在实战中效果有限。若强行将其混搭进魏国或吴国队伍，又会因阵营加成缺失导致属性差距。其战法神机妙算存在判定优先级问题，当敌方拥有先攻状态时，可能尚未触发控制就被先手击败。
针对这些弱点，玩家需注意战法联动与兵种调配。八门金锁阵、暂避其锋等减伤战法能弥补其防御短板，而搭配姜维、赵云等兼具输出与生存的武将可提升阵容容错率。在PK赛季环境中，合理利用形一阵、武锋阵等新阵法也能部分解决诸葛亮节奏偏慢的问题，但本质上仍需根据对手阵容灵活调整出战策略。
